O Papa Agatho (m. 681) serviu como bispo de Roma de 27 de junho de 678 até sua morte. Ele ouviu o apelo de Wilfrid de York, que havia sido deslocado de sua Sé pela divisão da Arquidiocese ordenada por Teodoro de Cantuária. Durante o mandato de Agato, o sexto Concílio Ecuménico foi convocado que tratou da controvérsia monotelitismo. Ele é venerado como um santo pelas Igrejas católicas e ortodoxas orientais.
Pouco é conhecido de Agato antes de seu papado, mas ele pode ter sido entre os muitos clérigos sicilianos em Roma naquela época, devido aos ataques do Califado à Sicília em meados do século VII. Ele serviu vários anos como tesoureiro da igreja de Roma. Ele sucedeu Donus no pontificado.
Pouco depois de Agatho se tornar papa, o bispo Wilfrid de York chegou a Roma para invocar a autoridade da Santa Sé em seu nome. Wilfrid foi deposto de sua sé por Dom Teodoro de Cantuária, que havia esculpido a diocese de Wilfrid e nomeado três bispos para governar as novas sés. Em um sínodo que o Papa Agato convocou no Latrão para investigar o caso, foi decidido que a diocese de Wilfrid deveria ser dividida, mas que o próprio Wilfrid deveria nomear os bispos.
O maior evento de seu pontificado foi o Sexto Concílio Ecumênico (680–681), após o fim do cerco muçulmano de Constantinopla, que suprimiu o monotelismo, que havia sido tolerado por papas anteriores (Honorius I entre eles). O conselho começou quando o imperador Constantino IV, querendo curar o cisma que separou os dois lados, escreveu ao Papa Dono sugerindo uma conferência sobre o assunto, mas Dono estava morto no momento em que a carta chegou. Agatho foi rápido para tomar o ramo de oliveira oferecido pelo imperador. Ele ordenou conselhos realizados em todo o Ocidente para que legados pudessem apresentar a tradição universal da Igreja Ocidental. Então enviou uma grande delegação para encontrar os orientais em Constantinopla.
Os legados e patriarcas se reuniram no palácio imperial em 7 de novembro de 680. Os Monotelitos apresentaram o seu caso. Então uma carta do Papa Agato foi lida que explicou a crença tradicional da Igreja de que Cristo era de duas vontades, divinas e humanas. O patriarca Jorge de Constantinopla aceitou a carta de Agato, assim como a maioria dos bispos presentes. O conselho proclamou a existência das duas vontades em Cristo e condenou o Monotelitismo, com o Papa Honório sendo incluído na condenação. Quando o conselho terminou em setembro de 681, os decretos foram enviados ao Papa, mas Agatho tinha morrido em janeiro. O Conselho não tinha apenas terminado o monotelismo, mas também tinha curado o cisma.
Agato também realizou negociações entre a Santa Sé e Constantino IV sobre a interferência da corte bizantina nas eleições papais. Constantino prometeu a Agato abolir ou reduzir o imposto que os papas tinham que pagar ao tesouro imperial em sua consagração.
Anastócio diz que o número de seus milagres lhe deu o título de Thaumaturgus. Morreu em 681, tendo mantido o pontificado cerca de dois anos. Ele é venerado como um santo por católicos e ortodoxos orientais. Seu dia de festa no cristianismo ocidental é em 10 de janeiro. Os cristãos orientais, incluindo as Igrejas Ortodoxas Orientais e Católicas Orientais, comemoram-no em 20 de fevereiro.