Filha do conde Favorino Scifi e abençoada Hortulana, ela foi criada em uma série de castelos em Assis, Itália. Sua irmã mais nova de Santa Clara de Assis, e seu primeiro seguidor, deixando casa duas semanas depois de Clare para se juntar aos beneditinos em San Angelo di Panzo aos quinze anos de idade. A família tentou trazer Agnes de volta pela força, arrastando-a do mosteiro, mas seu corpo tornou-se tão pesado que vários cavaleiros não poderiam brotá-la. Seu tio Monaldo tentou vencê-la, mas estava temporariamente paralisado. A família então deixou Agnes e Clare em paz. Em 1221, um grupo de freiras beneditinas em Monticelli pediu para se tornar pobre Clares, e São Francisco atribuiu Agnes como sua abadessa. Agnes escreveu sobre o quanto ela perdeu Clare e as outras freiras em San Damiano, e depois de estabelecer outros mosteiros de Clare no norte da Itália, Agnes foi lembrada em 1253 quando Clare estava morrendo. Agnes seguiu Clare na morte três meses depois.