Pilar e sua irmã gêmea Leonor foram os mais jovens de cinco filhos nascidos de Juana Ortiz de Zarate e Vicente Lopez de Maturana. Ambas as meninas eram conhecidas por sua piedade em sua juventude, e Leonor eventualmente se juntou aos carmelitas da caridade. Em 10 de agosto de 1903, Pilar entrou no noviciado do Mosteiro Mercedário Vera Cruz em Berriz, Espanha, tomando o nome de Margarita. Ela ensinou a escola e mais tarde serviu como diretor. Em 1922 sua saúde começou a sofrer, e ela desenvolveu uma úlcera duodenal que a atormentava o resto de sua vida. Mesmo dentro de uma ordem contemplativa de clausura, Margarita foi atraída para os missionários, e todas as noites passavam tempo em oração por seu trabalho; quando o interesse pelos missionários se desenvolveu em sua escola, ela formou um grupo dedicado a orar por eles. Ela eventualmente sentiu o chamado a se mover da vida contemplativa para o trabalho missionário, e a tomar como irmãs cuidadas com ela. Em setembro de 1924 sua casa pediu ao general superior de sua ordem para fazer o caso para eles, e em 23 de janeiro de 1926 eles receberam aprovação para um movimento experimental para as missões. Em 5 de novembro de 1926, um grupo chegou a Wuhu, China, e em 4 de março de 1928 outro chegou a Saipan nas ilhas Marianas do norte. Margarita foi nomeada Mãe Superior de sua casa em 16 de abril de 1927. Em 11 de novembro de 1928, ela chegou em Ponape, nas Marianas, em sua primeira viagem de missão. A obra que ela e as suas irmãs fizeram foi tão bem sucedida que, em 17 de maio de 1930, a Sagrada Congregação para os Religiosos aprovou fazer a casa em Berriz um Instituto Missionário. Em 30 de julho de 1931, a Mãe Margarita foi escolhida primeiro Superior Geral dos Missionários Mercedários de Bérriz, uma posição na qual ela serviu seus anos restantes. Ela fez duas viagens de missão mais longas para o Pacífico Sul, mas a úlcera eventualmente levou ao câncer, sua saúde falhou, e ela voltou para casa para o tratamento e para executar a administração de sua casa. Hoje há mais de 500 Irmãs Missionárias trabalhando em todo o planeta.