Ordenado em 1771, ele serviu por vários anos como pastor assistente em diferentes paróquias. Pároco parisiense em Saint Aubin, Louroux-Beconnais, França em 1788, com um ministério especial com os doentes. Na Revolução Francesa, ele foi obrigado a fazer um juramento de lealdade ao novo governo, um juramento que se opôs aos princípios da Igreja. Noel se recusou, e foi ordenado a abandonar sua paróquia, para não chegar mais perto dele do que oito milhas por pelo menos dois anos. Ele saiu, então voltou em segredo, e ministrou clandestinamente ao seu rebanho. Alguns de seus irmãos sacerdotes tomaram o juramento civil, mas Noel convenceu vários deles a aborrecê-lo, e devolver sua lealdade à Igreja. Em 1793, uma contra-revolução começou no oeste da França; quando essas forças ganharam algumas vitórias, Pinot voltou a ministrar abertamente ao seu rebanho. No entanto, as forças da Revolução começaram a ganhar novamente, e Pinot tornou-se um homem procurado. Capturado por soldados do governo enquanto se preparava para a missa, ele foi preso por doze dias; sentenciado à morte por se recusar a fazer o juramento, e encorajando outros a fazê-lo.