Filho mais velho de Antonio Agostini, médico e Agela Frattini; seu pai morreu quando Zefirino era muito jovem. Ordenado em 11 de março de 1837. Curado, ministro da juventude e catecista na igreja de São Nazarius por 8 anos. Atribuído como sacerdote a uma paróquia muito pobre em 1845. Estabelecida programas pós-escolares para meninas, instrução religiosa para mães e educação para as mulheres. Iniciou a devoção animada a Santa Angela Merici entre as suas paróquias femininas, e fundou a União Pia das Irmãs Devotadas a Santa Angela Merici, cuja regra foi aprovada pelo Bispo Ricabona em 1856. Em 2 de novembro de 1856, ele abriu sua primeira escola de caridade para as meninas pobres. Depois de 1860 algumas das mulheres locais que trabalhavam na escola escolheram a vida comunitária; o Padre Agostini preparou a primeira regra para a comunidade, e em 24 de setembro de 1869 os primeiros doze Ursulines fizeram sua profissão. Em 18 de novembro de 1869, fundaram a Congregação de Ursulines, Filhas de Maria Imaculada.